荧光显微镜主要用于观察‌细胞与组织结构‌：1、观察细胞形态、亚细胞结构、蛋白质定位及相互作用，追踪细胞动态过程 。2、活体成像‌：倒置荧光显微镜特别适合观察培养皿中的活细胞，支持长时间监测细胞生命活动 。3、分子标记‌：通过荧光染料或抗体染色，对特定物质进行定性和定量研究，如叶绿素等自发荧光物质 。